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菏泽学院在2002年升为本科院校之后，就一直考虑改名为大学的事，学校目前主要在“菏泽大学”和“鲁西大学”两个名字之间犹豫，“菏泽大学”这个名字比较稳妥，本地人也认可，“鲁西大学”听起来更大气，能够代表整个鲁西地区，其实这不只是选择名称的问题，而是关系到学校未来的发展方向，是要继续扎根本地，还是要向外拓展。

以前有人提过“国内牡丹大学”这个名字，听起来挺响亮，但2021年教育部出台了新规定，不允许新设的学校名称里带“国内”“中华”这些词，后来批准的康复大学、应急管理大学都是国家部委直接推动的项目，和菏泽学院这种省属普通本科院校没有关系，这条路早就走不通了。

山东这几年高校改名的情况很多，比如潍坊医学院改成了山东第二医科大学，滨州学院变成了山东航空学院，基本上都用了“地域加专业”这种组合方式，烟台那边的鲁东大学已经站稳了脚跟，和临沂大学、齐鲁工业大学一起，把山东分成了几块教育区域，如果菏泽真的叫作鲁西大学，那就补上了最后一块拼图，听起来挺顺的。

“鲁西大学”这个名称存在一些问题，“鲁西”不是正式的行政区域，菏泽能否代表整个鲁西地区存在疑问，而且“鲁东大学”已经注册，可能造成混淆，如果河南、河北也仿照这种命名方式，使用“豫西大学”“冀南大学”这样的名字，就会导致高校名称混乱，相比之下，“菏泽大学”听起来比较实际，但容易让人觉得是一所地方性小型院校，对外地学生缺乏吸引力，争取资源也比较困难。

更名这件事，现在不是学校自己就能决定的，山东教育厅要先看区域平衡情况，再看学校有没有达到标准，比如2026年前必须通过教育部本科评估，师资和科研平台都得跟上，目前菏泽学院还没正式提交材料，还在内部讨论阶段。

有人问为什么菏泽的大学不叫牡丹大学，毕竟菏泽是牡丹之乡，教育部以前就说过，高校名字要体现学科方向，不是用城市特产来命名，比如景德镇能叫陶瓷大学，是因为它确实有完整的陶瓷专业体系，而牡丹江大学后来被降为高职院校，就是因为它听起来像旅游宣传，如果菏泽硬要加上牡丹这个词，很可能被教育部退回。